El Vicerrectorado de Política Científica y Tecnológica ejercerá sus funciones a través de la siguiente estructura orgánica:
- Dirección General de Capital Humano Investigador.
- Dirección General de Recursos Científicos.
- Dirección General de Gestión y Apoyo I+D+i.
- Dirección General de Impacto I+D+i.
- Dirección General de I+D+i Campus Bahía de Algeciras.
- Dirección de Secretariado de Gestión del Conocimiento.
- Dirección de Secretariado de Apoyo al Personal Investigador.
- Dirección de Secretariado de Proyectos.
- Dirección del Servicio Central de Ciencia y Tecnología.
- Dirección del Servicio Central de Investigación de Cultivos Marinos.
- Dirección de las Escuelas Doctorales (conjuntamente con el Vicerrectorado de Política Educativa).
Tendrá relación directa en materia de investigación y transferencia con la Coordinación General del Campus de Excelencia del Mar (CEIMAR).